高新企业认定需要提供多种资料和证明，其中审计报告是重中之重，因为审计报告可以推测出企业的研发能力和市场前景，那接下来就着重讲一下专项审计的内容和难点！
一、专项审计定义：
高新企业认定专项审计是指注册会计师接受拟将申请高新申报的企业委托，对其近三个会计年度（实际经营不满三年的按实际经营年限）的研究开发费用和近一个会计年度的高新技术产品（服务）收入进行审计。
二、高新企业认定两大主要专审：
1、高新收入专项审计，这个审计主要是审查企业的高新收入，也就是高新技术产品（服务）创造的收入占公司的总收入的比例是否达到60%以上，也就是高新企业认定规定的要求；
2、研发支出的专项审计，也就是企业的研发投入支出要占到销售收入的一定比例，这个要根据企业的销售收入的规模从3%-5%不等而定。
这两个指标都是企业申请高新技术企业的硬指标，因此这两个专项审计报告须得具备且要符合条件且合理。
三、高新企业认定专项审计难点：
1、对于研发投入应重点关注研发支出、管理费用、原材料购入明细账、发出、结存明细表、相关费用分配表等，确认其结转研发费用额合理性及金额的准确性。
2、高度关注折旧费用与长期待摊费用摊销项目，属于研究开发项目和非研究开发项目共用的资产，在进行审计时要注意检查折旧或摊销的分配方法的合理性，保持前后各期分配的依据一致和正确。（高新申报的痛点难点怎么解决，来咨询：）
3、高度关注设计费用的付款申请审批单据，确认其费用发生的真实性及金额的准确性，委托设计费需关注协议等。
4、企业要关注委托外部研究开发投入项目，检查研究开发项目中委托外部研究开发的投入额是否按80%计入研究开发费用总额，若超过80％应提请申报企业调整，保证符合高新企业申报的规定要求。