中央空调能保证向房间输送新风，使房间始终保持空气清新、卫生。但分体空调无法送入新风，故难以确保空调房间空气的新鲜度；而如果通过开门、窗通风换气，则冷量就会大量损失，这不仅影响房间温度，而且浪费了能源。

分体空调运行管理灵活方便，且运行费用低于中央空调。中央空调制冷站虽可直接控制制冷机的开停时间和冷量大小，可根据气候变化进行调整，但只要有1个末端在用，空调主机必须开启。而分体空调如果只想开一个房间的话，只要开启相应房间的空调设备，其运行电费就小于中央空调。

中央空调可与装修施工密切配合实现豪华、明快之效果。中央空调管路和设备均可隐蔽在吊顶内，使不同功能的房间的装修做到各种造型的布局，实现现代建筑装修的特殊效果，给人以高雅、豪华、明快、舒适之美感。但分体空调的风冷式室外机须零散的悬挂在外墙上或装于室外地面上，影响外装修效果，而室内机则须挂在内墙上或安放在地面，又占用了室内空间，这无形中减小了房间的使用面积。

空调运行会发出一定的噪音，但是，如果噪音过大，则有可能是安装不当造成的。在安装时内机墙板没有钉牢，内机没有固定死，就容易导致噪音过大现象的出现。这种情况，安装人员通过试机，很容易发现并改正该问题。