利用畜禽粪便生产商品有机肥的主要目的可以概括为“四化”：
一是稳定化，通过集中好氧堆肥规模化处理使粪中的有机质得到降解，达到稳定的目的，避免物料发霉、发臭造成环境的二次污染；
二是无害化，通过杀灭寄生虫卵和病原微生物，防止传染病通过土地扩散，促进食品生产；
三是资源化，实现粪便循环利用，做到化害为利，变废为宝，为有机农业发展提供数量巨大、品质优良的肥料来源；
四是产业化，为养殖场构建一个新的经济增长点，通过采用有机肥工艺设备，实现规模化、标准化生产，将畜禽粪便堆肥后的物料进一步加工成符合行业标准的系列商品性有机肥产品。
上述“四化”中，稳定化是前提，无害化是核心，资源化是解决畜禽粪便出路的有效手段，产业化则是提高有机肥生产效益的重要举措。近年来，在化肥产能过剩、价格不断走高的形势下，有机肥以价低、绿色、环保等优势赢得了肥料行业和农民的青睐。
曝气式堆肥发酵反应器是一种集物料每天定量收集、存储及发酵腐熟功能为一体的好氧堆肥发酵反应装置。堆肥是将农业有机废弃物通过发酵降解成为稳定的、无害的、适合土壤培肥及土质环境修复的有机类肥料的一个过程。现在，农村小规模堆肥大多采用静态堆肥法，即把有机废弃物粉碎处理后，渗入调理剂、膨胀剂混合均匀堆成肥堆，使其发酵分解，成为有机肥料。这种堆肥方法，虽然简单、成本低，但所需时间较长，臭味较难控制，肥料肥力较差。其原因主要是在发酵过程中无法调节物料的温度和湿度。利用反应器堆肥，它在发酵过程中可运用物料翻堆、曝气、搅拌、混合、换气等手段来控制堆肥物料的温度，调节堆肥物料的湿度，以提高堆肥发酵速度，缩短堆肥周期，实现规模化堆肥生产的目的。