氨基酸的种类和含量
燕窝中的氨基酸种类丰富，富含苯丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸、酪氨酸和精氨酸等。燕窝中的水解氨基酸含量达42.272%，且必需氨基酸含量占氨基酸总量的42%；同时，呈鲜味特征的氨基酸（天门冬氨酸和谷氨酸）和呈芳香味特征的氨基酸（酪氨酸和苯丙氨酸）含量较高，表明燕窝的味道鲜美。食物营养价值的优劣主要取决于所含氨基酸的种类、数量和比例。联合国粮农组织和世界卫生组织提出了食品中必需氨基酸参考模式谱，规定了人体必需氨基酸占总氨基酸的质量比以及必需氨基酸与非必需氨基酸的质量比分别为40%和60%。
蛋白质
燕窝中的蛋白质含量较高，但与其品种关系紧密。试验选用的马来西亚金丝燕燕窝，其含量达50.26%。
唾液酸
唾液酸又称燕窝酸，是燕窝主要的生物活性成分，在燕窝中主要以N-乙酰神经氨酸形式存在。据报道，一般燕窝的唾液酸含量可达7%以上，这也是初步鉴定真假燕窝的手段。
燕窝是经过金丝燕喉部有很发达的粘液腺所分泌的唾液在空气中凝结成固体所形成的，是金丝燕摄食的昆虫、海藻、银鱼等物经消化后，吐唾筑建的鸟巢，呈白色，故称白燕，又称官燕，整个燕窝颜色较为白色，此白色为自然白且白中带点黄。黄燕：整个燕窝或燕窝大部分的地方颜色偏黄色，这是自然现象。从山洞采摘的燕窝也有部分呈现出不均匀的褐红色、血色、棕色或棕黄色，底部颜色较深，中间和边缘较浅。应该澄清的是此颜色并非来自燕子口中的血。其形成原因主要被认为是燕窝所处的环境如空气、湿度、岩石等共同作用的结果，尤其来自燕子栖息的环境及筑巢的燕洞壁含有高量铁质物质向燕窝的渗透。这部分燕窝被称为血燕。一般认为血燕的矿物质含量丰富，营养价值高于白燕，但并非所有矿物质都一定对人体有益。
染色燕窝
燕窝颜色呈现象牙白，或象牙白偏黄，存放时间过长或者日照时间较长的燕窝会呈现偏黄色。
染色燕窝，多是以低价的白燕染成红色或黄色，当作高价的血燕或黄燕来卖。这类假血燕、假黄燕在未湿水之前较难分辨。但一经浸泡、炖制即可辨认，因为真正的血燕及黄燕，由于是天然的颜色，所以浸泡、炖制后，不会变色。染色燕窝由于色素溶于水，清水随即被染成红色或黄色。且炖制1~2小时后，染色燕窝一入水，其质地软烂如白燕，而水却呈红色或黄色。
海藻燕窝
多见于燕饼或燕丝，利用廉价的海藻丝充填其中，真假混合。鉴别方法：天然燕窝条色泽通透稍带黄，有光泽，无异味。而海藻燕窝颜色实白，少光泽，质粗坚硬，有海藻味。