MES系统被广泛的应用在中大型企业工厂的生产制作领域，由于MES系统的应用，大大提高了工厂车间的生产效率和企业的人员的工作的效率。
1、MES系统能做到制程防呆。简单的说制程防呆就是指，银行卡插入ATM取款机，要输入密码才能进行交易或查询动作，在制造业中，你的上一个工序没有过，下一个工序将无法进行。
2、MES系统能配合WMS发料、MES上料做原料追溯。在产品销售出去后发现不良产品，可以反追回来当时生产这些不良产品用的材料明细。
3、管理层数据监控。可以通过MES的相关报表，看见当前生产线的一些状况，比如产能看板，能看见现在产能是否达标，如果不达标，能及时发现问题，去找寻瓶颈工位。
4、产品标签防重码，防错码。在超市购物，结算都是刷标签的，如果产品标签错了，收银台无法结账或结错帐。在设置条码规则后，MES系统能有效预防条码错误的问题发生。
5、防止短装出货。利用MES系统中的包装程序，设置每箱或每盒装多少时，系统会自动包装数量，防止短装造成客诉。
6、通过MES中的锁工单、锁生产站，可以在作业人员操作错误时锁住不让其生产，有利于品质部门及时防线问题。
7、MES通过扫描系统，记录每个产品在每个工站的生产时间和状态，便于品质追溯。