保函的主要区别： 保证是民法上的责任，是区别于物保的人的担保，是第三人和债权人约定，当债务人不履行或者不能履行其债务时，该第三人按照约定或法律规定履行债务或者承担责任的担保方式，分为一般保证和连带保证；保函是国际经济法上的责任，国际海上货物运输在《汉堡规则》中规定，托运人为了换取清洁提单可向承运人出具保函，保函只在托运人与承运人之间有效。我国海商法没有关于保函的规定，实践中参照以上规定。
功能 履约保函 能满足企业之间履行工程合同方面担保的需要。 预付款保函 能满足企业之间偿还预付款方面担保的需要。 投标保函 能满足企业之间投标方面担保的需要。 维修保函 能满足企业之间履行维修责任方面担保的需要。 预留金保函 能满足企业之间归还预留金方面担保的需要。 税款保付反担保函 能满足银行开户的加工贸易企业在中国银行为其向海关出具税款保付保函后，出具以中国银行为受益人的反担保函的需要。 海关风险保证金保函 能满足企业因开展加工贸易为免向海关缴纳风险保证金提供担保的需要。
税款保付反担保函 是指对在银行开户的加工贸易企业，银行可为该企业出具以中国银行为受益人的反担保函。加工贸易企业在开展加工贸易业务中为免向海关缴纳税款保证金，需委托中国银行出具以海关为受益人的税款保付保函。
保函性质： 1、是独立于委托人与担保人之间的反担保或委托人与受益人之间的合同或投标条件之外的。 2、是依据其规定的条件生效的，由担保人以保函中规定的任何单据为基础做出决定的。 3、是不可撤销的。