科学出版社秉承多年来形成的“高层次、高水平、高质量”和“严肃、严密、严格”的优良传统与作风，坚持以科学发展观推动变革与创新，在“立足科技，面向教育、多种媒体、综合经营”出版方针指导下，依托中国科学院和“科学家的出版社”的品牌优势，充分挖掘国内外优良出版资源，重视重大出版工程建设，形成了以科学（S）、技术（T）、医学（M）、教育（E）为主要出版领域战略架构。
科学出版社现在每年出书8000余种（含重印书），期刊200多种。形成了重大图书出版项目、工程集群： “十一五” 国家重点图书出版规划项目53个，“十一五”普通高校规划教材789项，每年大约有120个图书项目获国家科学技术学术著作出版基金、中国科学院出版基金、华夏基金资助。科学出版社拥有一个高水平、高质量、多品种的期刊方阵，30多种期刊收录入SCI、EI等国际检索系统，是中国科技期刊出版领域的“国家队”。
由北京地区出版产业竞争力研究课题组近几年连续刊发的《北京地区出版社竞争力排行榜》年度报告中，科学出版社的竞争力位居全国科技类出版社榜首，在全国出版社中名列第三、四位。
自1982年以来，科学出版社在历届科技图书评奖和科技期刊评奖中均名列前茅。1993年荣获国家首批“全国出版社”称号。2007年荣获“首届中国出版政府奖先进出版单位奖”。2009年荣膺“全国百佳图书出版单位”称号。
作为中国科学出版集团的核心企业，科学出版社正积极推进集团五年发展规划纲要的实施，明确主攻方向，狠抓战略重点，优化出版结构，推进产业创新，做强主业，做大主体，为完成集团“放量做强做大中国科技出版产业”的总体战略目标，为开创中国科技出版产业新局面，为促进中国科技国际交流与合作做出更大贡献